Với quy hoạch tổng thể này, có 9 dự án sẽ được ưu tiên thực hiện gồm: xây dựng các cửa ngăn mặn vùng ven biển, cải tạo và xây dựng đê biển, cải tạo vùng cù lao phía Bắc tỉnh Bến Tre, phát triển nguồn nước ngọt tỉnh Trà Vinh, quản lý nước vùng ven biển Bạc Liêu, luân chuyển dòng chảy tỉnh Cà Mau, điều chỉnh và cải tạo lịch thời vụ, phát triển năng lực quản lý dòng chảy ở ĐBSCL, nuôi tôm bền vững (mô hình luân canh lúa – tôm).
Bên cạnh đó, JICA còn thực hiện hàng chục chương trình, dự án nhỏ khác giúp phát triển kinh tế - xã hội, ổn định đời sống người dân của 7 tỉnh nêu trên. Trong đó, quan trọng nhất là dự án mở rộng và phát triển các giống cây chịu mặn, thiết lập hệ thống cảnh báo mặn sớm, phát triển các nguồn nước sinh hoạt, sử dụng hợp lý nguồn nước mưa, trồng cây ăn quả và cây chịu chua phèn, cải tạo và trồng rừng ngập mặn, nâng cấp và xây dựng đê sông, đê bao, cải tạo hệ thống tiêu nước, nâng cấp hệ thống cảnh báo lũ sớm...
